La conservazione è attuata attraverso attività di studio e inventariazione, prevenzione, restauro e digitalizzazione del patrimonio documentario.
Da alcuni anni l'Archivio sta procedendo a progressive operazioni di depolveratura del materiale archivistico e bibliotecario, sia presso la Sede di Forlì che presso la Sezione di Cesena, e a interventi di restauro e digitalizzazione, a mezzo di ditte specializzate, che hanno interessato in particolare documentazione catastale e di carattere militare, attualmente consultabile attraverso riproduzioni digitali sostitutive mediante una postazione dedicata dotata di computer.